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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
Data corrente: |
11/08/2014 |
Data da última atualização: |
25/05/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
RAPOSO, R. S.; SOUZA, I. G. B.; VELOSO, M. E. da C.; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; DINIZ, F. M. |
Afiliação: |
R.S. Raposo, Universidade Federal do Ceara, Núcleo de Biologia Experimental.; I.G.B. Souza, Universidade Federal do Piauí.; MARCOS EMANUEL DA COSTA VELOSO, CPAMN; ADILSON KENJI KOBAYASHI, CNPAE; BRUNO GALVEAS LAVIOLA, CNPAE; FABIO MENDONCA DINIZ, CPAMN. |
Título: |
Development of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 3, p. 6099-6106, Aug. 2014. |
DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/2014.August.7.25 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The last few years have seen a significant increase in the number of large-scale sequencing projects generating whole genome databases. These sequence databases can be surveyed (genome sequence survey) for tandem repeats as an alternative means to develop microsatellites for monitoring and selecting natural populations and cultivars of Jatropha curcas. A total of 100 tandem repeats were revealed from mining 368 genomic surveyed sequences available in the Kazusa DNA Research Institute database. Twenty microsatellite sequences were successfully amplified, resulting in repeatable and scorable polymerase chain reaction products. Genotyping of J. curcas accessions from the Guatemalan population revealed 18 polymorphic loci. The average number of alleles per locus was 6.9, and allelic sizes ranged from 94 to 299 bp. Expected and observed heterozygosities ranged from 0.118 to 0.906 and from 0.082 to 0.794, respectively. Polymorphic information content values ranged from 0.114 (JcSSR-34) to 0.886 (JcSSR-33) with an average of 0.627. Analysis with Micro-Checker indicated few null alleles for locus JcSSR-37 in Guatemalan populations, which may be a possible cause of its deviation from Hardy-Weinberg equilibrium, even after Bonferroni?s correction. No loci showed significant linkage disequilibrium. These microsatellite loci are expected to be valuable molecular markers in J. curcas because they show high levels of polymorphism and heterozygosity. |
Palavras-Chave: |
Biofuel; Energy crop; Genetic diversity; Microsatellites; Microssatélite; Physic nut. |
Thesagro: |
Biocombustível; Cultura energética; Euphorbiaceae; Pinhão de purga; Planta oleaginosa. |
Categoria do assunto: |
-- G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/125432/1/ArtigoMarcosFabioGMR2014.pdf
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Marc: |
LEADER 02543naa a2200325 a 4500 001 2017730 005 2022-05-25 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.4238/2014.August.7.25$2DOI 100 1 $aRAPOSO, R. S. 245 $aDevelopment of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aThe last few years have seen a significant increase in the number of large-scale sequencing projects generating whole genome databases. These sequence databases can be surveyed (genome sequence survey) for tandem repeats as an alternative means to develop microsatellites for monitoring and selecting natural populations and cultivars of Jatropha curcas. A total of 100 tandem repeats were revealed from mining 368 genomic surveyed sequences available in the Kazusa DNA Research Institute database. Twenty microsatellite sequences were successfully amplified, resulting in repeatable and scorable polymerase chain reaction products. Genotyping of J. curcas accessions from the Guatemalan population revealed 18 polymorphic loci. The average number of alleles per locus was 6.9, and allelic sizes ranged from 94 to 299 bp. Expected and observed heterozygosities ranged from 0.118 to 0.906 and from 0.082 to 0.794, respectively. Polymorphic information content values ranged from 0.114 (JcSSR-34) to 0.886 (JcSSR-33) with an average of 0.627. Analysis with Micro-Checker indicated few null alleles for locus JcSSR-37 in Guatemalan populations, which may be a possible cause of its deviation from Hardy-Weinberg equilibrium, even after Bonferroni?s correction. No loci showed significant linkage disequilibrium. These microsatellite loci are expected to be valuable molecular markers in J. curcas because they show high levels of polymorphism and heterozygosity. 650 $aBiocombustível 650 $aCultura energética 650 $aEuphorbiaceae 650 $aPinhão de purga 650 $aPlanta oleaginosa 653 $aBiofuel 653 $aEnergy crop 653 $aGenetic diversity 653 $aMicrosatellites 653 $aMicrossatélite 653 $aPhysic nut 700 1 $aSOUZA, I. G. B. 700 1 $aVELOSO, M. E. da C. 700 1 $aKOBAYASHI, A. K. 700 1 $aLAVIOLA, B. G. 700 1 $aDINIZ, F. M. 773 $tGenetics and Molecular Research, Ribeirão Preto$gv. 13, n. 3, p. 6099-6106, Aug. 2014.
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
Data corrente: |
19/12/2016 |
Data da última atualização: |
23/05/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
COSTA, K. J. A.; LAMEIRA, O. A.; ASSIS, R. M. A. de; MOURA, R. |
Afiliação: |
Keila Jamille Alves Costa, BOLSISTA CPATU; OSMAR ALVES LAMEIRA, CPATU; Rafael Marlon Alves de Assis, Bolsista PIBIC/CNPq; Raíssa Moura, BOLSISTA CPATU. |
Título: |
Aspectos fenológicos do melhoral - Evolvulus glomeratus nees & C. Mart. (Convolvulaceae). |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
In: ENCONTRO AMAZÔNICO DE AGRÁRIAS, 8., 2016, Belém, PA. Anais... Belém, PA: [s.n.], 2016. |
Páginas: |
p. 46-50. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Livro VI - Produção vegetal. |
Conteúdo: |
Evolvulus glomeratus Nees & C. Mart., pertence a família Convolvulaceae. Originária da América do Sul. No Brasil sua ocorrência é presente em todas as regiões e com diversos nomes populares como o melhoral, tendo propriedades medicinais como antitérmico, dores corporais. O estudo sobre a fenologia oferece informações que podem ser aplicadas para o uso e coleta de material vegetal. O objetivo do estudo foi de avaliar o período reprodutivo do melhoral, correlacionando com a precipitação pluviométrica, visando identificar a época mais adequada para a coleta e uso das folhas da espécie. Os valores de precipitação pluviométrica foram fornecidos pelo Instituto Nacional de Meteorologia (INMET), utilizando-se a média acumulada mensal para o período de janeiro de 2014 a dezembro de 2015. Para as observações fenológicas foram selecionados 7 indivíduos de mehoral. Os meses de outubro e novembro apresentaram as maiores médias de dias de floração, respectivamente, com 20 e 16 dias, coincidindo com as menores precipitações pluviométricas. No mês de setembro foi registrada a menor média de floração com 1 dia. Não ocorreu frutificação para o período estudado. O melhoral apresentou fenofases influenciadas pela precipitação pluviométrica. |
Palavras-Chave: |
Precipitação. |
Thesagro: |
Fenologia; Floração; Frutificação. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/152017/1/Ennag2016-p46.pdf
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Marc: |
LEADER 01972nam a2200217 a 4500 001 2058912 005 2022-05-23 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aCOSTA, K. J. A. 245 $aAspectos fenológicos do melhoral - Evolvulus glomeratus nees & C. Mart. (Convolvulaceae).$h[electronic resource] 260 $aIn: ENCONTRO AMAZÔNICO DE AGRÁRIAS, 8., 2016, Belém, PA. Anais... Belém, PA: [s.n.]$c2016 300 $ap. 46-50. 500 $aLivro VI - Produção vegetal. 520 $aEvolvulus glomeratus Nees & C. Mart., pertence a família Convolvulaceae. Originária da América do Sul. No Brasil sua ocorrência é presente em todas as regiões e com diversos nomes populares como o melhoral, tendo propriedades medicinais como antitérmico, dores corporais. O estudo sobre a fenologia oferece informações que podem ser aplicadas para o uso e coleta de material vegetal. O objetivo do estudo foi de avaliar o período reprodutivo do melhoral, correlacionando com a precipitação pluviométrica, visando identificar a época mais adequada para a coleta e uso das folhas da espécie. Os valores de precipitação pluviométrica foram fornecidos pelo Instituto Nacional de Meteorologia (INMET), utilizando-se a média acumulada mensal para o período de janeiro de 2014 a dezembro de 2015. Para as observações fenológicas foram selecionados 7 indivíduos de mehoral. Os meses de outubro e novembro apresentaram as maiores médias de dias de floração, respectivamente, com 20 e 16 dias, coincidindo com as menores precipitações pluviométricas. No mês de setembro foi registrada a menor média de floração com 1 dia. Não ocorreu frutificação para o período estudado. O melhoral apresentou fenofases influenciadas pela precipitação pluviométrica. 650 $aFenologia 650 $aFloração 650 $aFrutificação 653 $aPrecipitação 700 1 $aLAMEIRA, O. A. 700 1 $aASSIS, R. M. A. de 700 1 $aMOURA, R.
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Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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